Directeur GGZ Nederland sinds 1 januari 2011. Lid bestuur Stichting Samen Sterk Zonder Stigma, Lid bestuur Jeugdpoort, Voorzitter samenwerkende Branches Gespecialiseerde zorg voor Jeugd, Lid Bestuur IZA (Informatievoorziening Zorgaanbieders in het sociaal domein), en sinds november 2015 Voorzitter van de ledenraad van Vogelbescherming Nederland.
Van 2000 tot 2011 werkte Van Rooij bij Zorgverzekeraars Nederland, vanaf 2008 als adjunct-directeur zorg, met als belangrijkste aandachtsgebieden de ontwikkelingen op het stelsel, inkoop en kwaliteit van AWBZ, ggz en internationale zaken.